मदुरै के पास उन दिनों से एक शानदार इतिहास है जब शहर पांडिया राजवंश द्वारा शासित था। सुल्तानों के शासनकाल के दौरान, मलिक काफूर ने शहर को बर्बाद कर दिया।
मलिक काफूर (1296-1316) एक नपुंसक दास था जो 1296 से 1316 तक दिल्ली सल्तनत के शासक अलाउद्दीन खिलजी की सेना में जनरल के रूप में सेवा कर रहा था। वह दिल्ली सल्तनत के लिए विंध्य पर्वत से परे सल्तनत राज्य का विस्तार करने के लिए जिम्मेदार था। उन्होंने न केवल दिल्ली के सल्तनत के अधीन दक्षिण के शासकों को लाया था, बल्कि वह एक ऐसे व्यक्ति भी था जिसने मंदिरों, जनता और दक्षिण के शासकों की संपत्ति लूट ली थी। दक्षिण के हिंदू मंदिरों को नष्ट करने का उनका कार्य इतिहास में अच्छी तरह से दर्ज किया गया है। मदुरै मलिक काफूर द्वारा बर्बरता के लिए अपवाद नहीं है। दक्षिण में स्वामित्व वाले क्षेत्रों में दिल्ली सल्तनत के प्रतिनिधि की नियुक्ति कर ने के बाद, वह लूट के साथ दिल्ली चले गए।
मुस्लिम इतिहासकार जियाउद्दीन बरानी के मुताबिक, मलिक काफूर 241 टन सोना, 20000 घोड़े और 612 हाथी लूट वाले खजाने के साथ दिल्ली वापस गए।
विजयनगर साम्राज्य का हिस्सा बनने के बाद और उसके बाद नायक के शासन के दौरान इस शहर कि अपनी महिमा को वापस लाया गया था । विजयनगर के राजा कृष्णादेवराय ने विजयनगर के संरक्षण में स्थित पांडियों को लूटने के लिए विरशेखर चोल को दंडित करने के लिए अपने जर्नल नागामा नायक को मदुरै भेजा। चोल को हराकर, नागामा ने अपने आप को मदुरै को राजा के रूप मे घोषित किया। उत्तेजित, कृष्णादेवराय ने नागामा नायक के पुत्र विश्वनाथ नायक को अपने पिता को शाही अदालत में पेश करने के लिए भेजा। अपनी वफादारी के लिए एक पुरस्कार के रूप में विश्वनाथ नायक को 1530 के दौरान मदुरै का शासक बनाया गया था। विश्वनाथ नायक और उनके बेटे कृष्णप्पा नायक ने 1565 तक लगातार विजयनगर राया का समर्थन किया, जब कृष्णा नायक ने अपने पिता के सक्षम मंत्री एरियानाथ मुदलियार की मदद से एक स्वतंत्र मदुरै साम्राज्य की स्थापना की।
वर्तमान में मदुरै बहुत सुविधाओं वाला एक व्यस्त शहर है। नायक की समय के दौरान बहुत मंदिरो का निर्माण हुआ बाद में कई मंदिरों का दौरा किया जाता है। परिवहन व्यवस्था बहुत अच्छी है क्योंकि कई जगह आसानी से जा सकते हैं। स्थानीय व्यापार ज्यादातर पर्यटकों पर निर्भर करता है; इसलिए वे पर्यटको के अनुकूल हैं। रामेश्वरम जाने वाले बहुत से भक्त, इस मंदिर के शहर को देखने से नही चुकते । यद्यपि श्री मीनाक्षी मंदिर कई आगंतुकों के लिए आकर्षण का केंद्र है, लेकिन भगवान कार्तिक, विष्णु आदि के लिए मदुरै के आस-पास बहुत से पवित्र मंदिर हैं।
'कृष्ण रायर टेप्पकुलम' नामकजगह शहर की सीमाओं के भीतर अन्ना बस टर्मिनस और तिरुपाराकुंड्रम के बीच स्थित है। अन्ना बस टर्मिनस से या पेरियार बस टर्मिनस से आसानी से कोई भी इस जगह पहुंच सकता है। तमिल में 'तेप्पकुलम' शब्द का अर्थ है एक विशाल तालाब जहां एक समारोह आयोजित किया जाता है जिसमें एक अच्छी तरह से सजाए गए तैरने वाला तख्त में तालाब के चारों ओर भगवान और देवी के उत्सवमूर्ति को लाने की व्यवस्था की जाती है। यह कई मंदिरों का एक सामान्य वार्षिक कार्य है, जिसमें स्वयं का एक तालाब है। ऐसा तालाब जहां इस तरह के एक समारोह आयोजित किया जाता है उसे 'तेप्पकुलम' कहा जाता है।
आज, इस जगह में कोई तालाब नहीं है, लेकिन 'तेप्पकुलम' जगह के नाम से पता चलता है कि वहां पहले एक तालाब होना चाहिए था। और इस तालाब [कुलम] में एक तैरने वाला तख्त में तालाब के चारों ओर भगवान और देवी के उत्सवमूर्ति लाने का वार्षिक कार्य आयोजित किया जाता था।
तालाब का नाम शासक 'कृष्णाराय' के नाम पर रखा गया था। यह कृष्णदेवराय के बाद हो सकता है या यह कृष्णप्पा नायक के बाद भी हो सकता है, क्योंकि 'राय' शब्द किसी शासक के साथ चिपक सकता है। सभी संभावनाओं में इसे कृष्णदेवराय के नाम पर रखा जाना चाहिए था क्योंकि दोनों विश्वनाथ नायक और उनके बेटे कृष्णप्पा नायक पूर्व के प्रति वफादार थे।
आम तौर पर तप्पकुलम उस मंदिर का हिस्सा बनेंगे जिसका देवताओं को तैरने वाला तख्त में लाया जाता है। हालांकि, यह स्पष्ट रूप से ज्ञात नहीं है कि इस विशेष 'टेप्पकुलम' को किस मंदिर से जोड़ा गया था।
विजयनगर साम्राज्य के नियंत्रण में क्षेत्रों में श्री अंजनेय स्वामी [हनुमान] की पूजा के लिए राजगुरु श्री व्यासराय का प्रभाव ज्ञात है। उन्होंने और उनके शिष्यों ने श्री हनुमान को ’मुख्य प्राण’ का नाम मे कई मंदिरों की स्थापना की और भगवान की पूजा को प्रोत्साहित किया। उन्होंने श्री माधवाचार्य द्वारा स्थापित 'द्विता' सिद्धांत का पालन किया था। यह मदवा अनुयायियों के तालाब के किनारे पर मठ स्थापित करने का रिवाज है। तालाब की सी्ढ़ी या तट पर हनुमान शिला स्थापित करना भी परंपरागत है।
इस तरह के एक अभ्यास के अनुसार, मदवा मठ ने 'कृष्णाराय टेप्पकुलम' के तट पर श्री हनुमान के लिए एक मंदिर स्थापित किया था। ऐसा लगता है कि मंदिर का मुख्य गर्भगृह छोटा था और मंदिर के बाकी हिस्सों मे समुदाय को धर्मशाला [यात्रा मे विश्राम गृह] के रूप में सेवा दी है। मठ द्वारा मंदिर को अच्छी तरह से बनाए रखा जाना चाहिए। इन सभी वर्षों में बिना किसी रुकावट के मदवा पुजारियों द्वारा दैनिक पूजा आयोजित की जाती है।
मंदिर का पुनर्निर्माण किया गया था और 1903 के दौरान कुंभाभिषेक आयोजित किया गया था। वर्ष 1984 में अस्सी वर्षों के अंतराल के बाद मुख्य अभयारण्य का विस्तार किया गया था। अगले ही साल ब्राह्मण एसोसिएशन ने भजन के संचालन और मंदिर से संबंधित अन्य कार्यों के लिए पैंतीस फुट और साठ फीट कि एक बड़ा हॉल बनाया था।
6 मई 1988 को, भगवान सेंधिल [कार्तिक / मुरुगन] की शिला उनकी पत्नी के साथ स्थापित की गई थी। 2 जुलाई 1990 को तीन तिहाई राजगोपुरम और भगवान के लिए नया विमानम पूरा हो गया और कुंभाभिषेक आयोजित किया गया।
कुछ दाताओं की मदद से मंदिर के आंतरिक हिस्सों का नवीनीकरण किया गया था और पूरे फर्श को नई टाईल्स के साथ फिर से रखा गया था और काम 10 फरवरी 1995 को पूरा हो गया था।
मंदिर का मुख्य अभयारण्य सड़क से ही देखा जा सकता है। भगवान अंजली हस्त के साथ गंभीरता से खडे देखे जाते है। ढाई फीट विग्राह भक्तों की आंखों को शीतलता प्रदान करता है। ऐसा लगता है कि वह इस मुद्रा में भक्तों की पूरी गतिविधि की देखरेख कर रहा है। वह दोनों कानों खड़ा है, जैसे कि वह भगवान श्रीराम को भेजे जाने के लिए अपने भक्तों की ईमानदारी से प्रार्थना सुनरहे है।
यह श्री मदवा मठ मंदिर में भगवान हनुमान को ’मुख्य प्राण’ का नाम से अंजली हस्त से देखना असामान्य है। आम तौर पर भगवान को पूंछ के साथ एक अर्धा शिला रूप में देखा जाता है। यह काफी संभव है कि मूल शिला समय के साथ वर्तमान कारण के साथ एक कारण या दूसरे के लिए बदल दिया गया। लेकिन, यह ध्यान दिया जाना चाहिए कि मठ द्वारा पूजा सभी के साथ जारी रही थी।