'वामन पुराण' के अनुसार, वरुण और असी दो नदियां हैं जो मूल पुरुष के शरीर से निकली हैं। दोनों नदियों के बीच लगी भूमि का मार्ग 'वाराणसी' माना जाता है, जो सभी तीर्थ केंद्रों में सबसे पवित्र है - प्राचीन काल से अस्तित्व में यह शहर जिसने कई ऋषि और संतों को प्रबुद्ध किया है। इस महान शहर द्वारा संरक्षित पूर्ववर्ती द्विजियाई संस्कृति अतीत की भव्यता की स्थायी गवाही है। यह कथन कि शहर पुराना है, तो कोई भी किंवदंती मूल्यांकन के अधीन है। वाराणसी पारंपरिक शास्त्रीय संस्कृति का शहर हिंदू धर्म का सूक्ष्म जगत है। मिथक और किंवदंती द्वारा महिमा और धर्म द्वारा पवित्र, इसने हमेशा बड़ी संख्या में तीर्थयात्रियों और आत्मा के साधकों को आकर्षित किया है। शहर को 'काशीपुरी' के रूप में भी जाना जाता है और कास शब्द का अर्थ चमकना है।
जबकि इस शहर में रहने वाले कई संत और ऋषि थे, उनमें से प्रसिद्ध, नया अभिनव समय के संत हैं, श्री गोस्वामी तुलसीदासजी, श्री कबीर दासजी, श्री रामनाथजी। इन सभी संतों के कामों की वस्तुतः पूजा की जाती है और प्रचारित दार्शनिक विचारों के लिए प्रसिद्ध हैं। हालांकि, श्री गोस्वामी तुलसीदासजी के काम को कई लोगों द्वारा याद किया जाता है, क्योंकि उसमें इस्तेमाल की जाने वाली भाषा को आम व्यक्ति भी समझ जाता था। उसी समय, पंडितों ने भी उन्हें मूल्यवान पाया।
भगवान हनुमानजी का शायद ही कोई भक्त होगा जो श्री तुलसीदासजी द्वारा लिखी गई चालीस श्लोकों से अनजान होगा, जिसका नाम "हनुमान चालिसा" है। यह दुनिया भर में भगवान हनुमानजी के भक्तों द्वारा सुनाई जाने वाली सबसे शक्तिशाली और लोकप्रिय रचना है। भक्ति यह है कि यह भजन भगवान के प्रति विकसित होता है और इसका अनुभव और आनंद लिया जाना चाहिए। यदि लाखों इस भक्ति का अनुभव कर सकते हैं, तो जिस शक्ति के साथ भजन बनाया गया था, उसका अनुमान लगाया जा सकता है। भगवान हनुमानजी की भक्ति सबके अनुमान से परे है। यह एक सिद्ध अनुदान है और श्री तुलसीदासजी, एक सिद्ध पुरुष है। यह एक सिद्ध ग्रन्थ है और श्री तुलसीदासजी, सिद्ध पुरुष हैं।
ऐसा कहा जाता है कि जब भी श्री तुलसीदासजी रामायण का पाठ करते थे तो वे सामने की एक आसन खाली रखते थे और रेशमी कपड़े से ढका होता था। वह अपने भगवान हनुमानजी के लिए आसन रखते थे, जो "यत्र यत्र रघुनाथ कीर्तनम् तत्र तत्र कृतमस्तकाञ्जलीं" कहावत को ध्यान में रखते हुए कहते थे कि राम चरितम् सुनने के लिए आना निश्चित है। आज तक कई कथाकार रामायण का पाठ करते समय भगवान हनुमानजी के लिए आसन रखने की इस प्रथा का पालन करते हैं। जब वह वाराणसी के महान शहर में रामायण पर प्रवचन दे रहे थे, तो वे भगवान हनुमानजी को भीड़ में देखने के लिए उत्सुक थे और हर रोज वे भगवान के दर्शन के लिए तत्पर रहते थे। जिज्ञासा तेज होने के साथ, एक दिन वह भीड़ के एक कोने में एक कुष्ठरोगी बैठा था, जो बड़ी उत्सुकता से कहानी सुन रहा था और भगवान राम की गहरी भक्ति की भावना के साथ पूरी तरह से डूब गया था। श्री तुलसीदासजी समझ गए कि वे भगवान हनुमानजी के अलावा कोई नहीं हैं और दिन के लिए कथा समाप्त होने के बाद उनका पीछा करने का फैसला किया। श्री तुलसीदासजी ने कथा समाप्त के बाद उन्हें देखा और उनका अनुसरन(पीछा) करने लगे। वह श्री तुलसीदासजी को चकमा देने की कोशिश कर रहा था।
अंत में लंका के नाम से जानी जाने वाली जगह की ओर दक्षिण की ओर कुछ अच्छी दूरी तय करने के बाद, श्री तुलसीदासजी उनसे आगे निकल गए। और इस दृढ़ विश्वास में कि जिस व्यक्ति का वह अनुसरन कर रहे थे, वह भगवान हनुमानजी थे, उन्होंने उस व्यक्ति के पैर पकड़ लिए और प्रणाम कर के कहा "ओह! मेरे भगवान हमुमते नमः! तनय है, आप जैसे लोग मुझे दर्शन देने आए हैं। मैं चाहूंगा मेरे प्रभु को उसकी पूर्ण महिमा रूप में देखू। कृपया मुझ पर दया करें कि मैं आप को आपके स्वयं के रौशन रूप में देखू ”। कोढ़ी - भगवान हनुमानजी के अलावा और कोई नहीं - श्रीमद रामायण के भक्त और संगीतकार की दुर्दशा देख सकते थे, और भगवान हनुमानजी के रूप में अपना मूल रूप ले लिया। भगवान हनुमानजी को अपने रूप में देखकर श्री तुलसीदासजी को बड़ी प्रसन्नता हुई। अपने भगवान के कुछ मिनटों तक देख्नने के बाद उन्होंने कहा कि "आपके दर्शन होने से मुझे अपने अगले जन्म मे राहत मिली है। अब जब मैं अगले जन्म से मुक्त हो गया हूँ, तो मेरे भगवान कृपया मुझे इस जन्म के दौरान भगवान राम के दर्शन कराने में मदद करें"। भगवान हनुमान अपने भक्त पर मुस्कुराए। अपने दाहिने हाथ को उठा और साथ उसके बाएं हाथ को उसके दिल पर रख के कहा "जब समय आयेगा तो मैं आपको चित्रकूट बुलाऊंगा और हमारे भगवान राम के दर्शन करने में मदद करूंगा"।
श्री तुलसीदास जी ने अपने भगवान से एक और निवेदन किया- कि वे इस क्षेत्र पर आने वाले सभी लोगों को आशीर्वाद दें। भगवान हनुमानजी ने पुष्टि की कि वह उनकी इच्छाओं को मानेंगे। मै उसी स्थान पर यहाँ भक्तों को आशीर्वाद देने के लिये रहुगा। ऐसा माना जाता है कि श्री तुलसीदास जी की इच्छा के अनुसार, श्री हनुमानजी ने स्वयंभू रूप धारण किया है और आस्था के साथ यहां आने वाले सभी भक्तों को अपना आशीर्वाद देते हैं।
यह स्थान वाराणसी में लंका के रूप में जाना जाता है और बनारस हिंदू विश्वविद्यालय के पास है। भगवान हनुमानजी के लिए एक छोटा सा कुटिया बनाया गया था, जहाँ पर भगवान श्री तुलसीदास जी को दर्शन दिए थे। यह एक सुव्यवस्थित रहस्य है कि भगवान हनुमानजी यहाँ उसी रूप में दिखाई दे रहे हैं जैसे उन्होंने श्री तुलसीदास जी को दर्शन दिया था। भगवान हनुमानजी अपने दाहिने हाथ को उठा हुआ है [अभय हस्त], और साथ उसके बाएं हाथ को उसके हृदय में है। चूँकि इस क्षेत्र के भगवान हनुमान के आशीर्वाद से भक्तों की सभी परेशानियाँ दूर हो जाती हैं, इसलिए हनुमान को श्री संकट मोचन हनुमान के नाम से जाना जाता है।
मंदिर शुरू में छोटा था और उस समय के महंतों की मदद से विभिन्न प्रकार के अतिरिक्त निर्माण किए गए थे और आज मंदिर परिसर बहुत अच्छी तरह से बनाए रखा गया है। मंदिर में तीर्थयात्रा पर आने वाले भक्तों के ठहरने के लिए कमरे हैं। प्रातः पाँच बजे प्रातः आरती में भक्त अच्छी संख्या में भाग लेते है। रात्रि की आरती को भगवान संकट मोचन हनुमान को रात लगभग साढ़े आठ बजे किया जाता है। मंदिर के दरवाजे को बंद करने से पहले स्याना आरती रात में लगभग दस बजे की जाती है। उस समय, मधुर प्रकाश में, प्रभु के दर्शन करने के लिए एक अद्भुत अनुभव है जो व्यक्ति अपने जीवनकाल में कर सकता है। भोजन के बाद, मंदिर दोपहर बारह से तीन बजे के बीच बंद कर दिया जाता है।
मंगलवार और शनिवार को अखंड संकीर्तन, मानस पाठ विशेष रूप से किष्किन्धा और सुंदरकांड का जप किया जाता है। कार्तिक कृष्ण चतुर्दशी के दिन सूर्योदय के समय विशेष पूजा होती है। चित्रा सुकोला पूर्णिमा के दिन, मंदिर मे महोत्सव आयोजित किया जाता है और उस दौरान जुलूस और कई झांकी निकाली जाती हैं। इसी अवधि के दौरान रामायण, विराट संगीत पर कई कार्यशालाएं चार दिनों के लिए आयोजित की जाती हैं।